Als der Himmel über New York geöffnet wurde und die Stadt bereit ist, Horden von feindlichen Außerirdischen zu überwältigen, können nur vier tapfere Teenage Mutant Ninja Schildkröten die Invasion stoppen. Den Plan umsetzen. Ja, er ist es wieder, lange Zeit der Feind unserer Helden. Schroeder verschworen sich mit Craig, einer Kreatur aus Dimension X. Dieses Superhirn im Körper eines riesigen Androidums hat ein Portal über der Stadt geöffnet, und nun steuert seine mobile Festung Technodrom den Luftraum. Mit Hilfe von April O ‚ Neill erfahren die Schildkröten, dass der Fuß-Clan und sein Anführer dem wahnsinnigen Wissenschaftler Baxter Stockman das Labor besucht haben, wo sie mit Hilfe eines fortgeschrittenen Mutagen zwei Supermutanten – Rocstedi und bebop kreierten. Dieses Paar erschwert die Aufgabe für Leonardo und seine Brüder sehr, aber unerwartet kommt in ihrem Team wieder aufzufüllen-die Helden-Single Casey Jones ist bereit, Schulter an Schulter mit den Schildkröten gegen die neue Bedrohung zu kämpfen. Das einzige, was übrig bleibt, ist, Pizza zu essen und zu kämpfen!
